Po 2–21 dienų po infekcijos pasireiškia pirmieji Ebolos simptomai: karščiavimas, intensyvus silpnumas, sąnarių ir raumenų skausmas, galvos skausmas ir laringitas, po to vėmimas, viduriavimas ir pilvo skausmas. Nuo penktos iki septintos dienos gali išsivystyti būdingi bėrimai su dėmėmis ir mažais burbulais.
Ligos progresavimo metu gali pasireikšti kepenų ar inkstų nepakankamumas, krešėjimo sutrikimai ir kraujavimas iš virškinimo trakto gleivinės ir lytinių organų. Pacientas paprastai turi nuo 6 iki 16 dienų kovoti ir nugalėti virusą, kitaip sunkus kraujavimas ir širdies ir kraujagyslių kolapsas gali sukelti mirtį. Mirtingumas skiriasi priklausomai nuo Ebola viruso padermės ir teikiamos priežiūros.
