Maliarija yra labai sena liga, kuri visada buvo susijusi su žmogaus istorija.
Jau Kinijoje 2700 m. Pr. Kr. Buvo žinomi kai kurie būdingi ligos simptomai. Tačiau pirmoji nuoroda į visišką klinikinį malarijos vaizdą yra Hipokrato (Graikija, 4 a. Pr.), Kuri apibūdina tipišką pertrūkį ir pirmiausia sukuria ryšį tarp maliarijos infekcijos ir pelkių buveinių.
Vėliau maliarija išplito į Italiją, kur hidrauliniai darbai ir romėnų gebėjimas gydyti žemės ūkio sritis trukdė ligos eigai. Kai Romos imperija prarado grožį, vėl atsirado protrūkių, dėl kurių iki viduramžių buvo atliktas ilgas melioracijos darbas.
Žodžio „ maliarija “ etimologija kyla iš Italijos viduramžių termino „ mal aria “, o tai reiškia blogą orą . Prancūzijoje buvo pageidautina naudoti lotynišką išvestinę „ paludisme “ (iš tikrųjų malariją vadinama paludizmu), remiantis tuo įsitikinimu, kad ligą sukėlė minkštas oras, kilęs iš pelkių zonų. Terminas "maliarija" tapo ligos sinonimu tik XIX a. Pabaigoje.