Geltoną karštligę galima išvengti vakcinacijos, kuri suteikia ilgalaikį imunitetą (daugiau nei 10 metų), veiksmingą 90–95% recipientų.
Vakciną, kurią šiuo metu patvirtina Pasaulio sveikatos organizacija, sudaro gyvas geltonasis karščiavimas virusas, kuris yra 17D padermė, auginama vištienos embrione. Vakcina sušvirkščiama į viršutinę ranką su vienkartine doze, kuri atnaujinama kas 10 metų. Apsauginiai antikūnai pasireiškia nuo 7 iki 10 dienų po inokuliacijos.
Vakcinacija, be to, kad ji yra privaloma kai kurioms vietoms, yra rekomenduojama keliautojams, vykstantiems į endemines Afrikos ir Amerikos vietas. Kita vertus, geltonosios karštinės vakcina yra kontraindikuotina vaikams iki 4 mėnesių ir nėščioms moterims; ypatingas atsargumas taip pat rekomenduojamas žmonėms, alergiškiems vištienos ar kiaušinių baltymams, pacientams, kurių imuninė sistema yra sutrikusi dėl ligos ar gydymo, vaikams iki 9 mėnesių ir pagyvenusiems asmenims.
