Toksoplazmozės perdavimo vaisiui tikimybė skiriasi priklausomai nuo nėštumo laikotarpio, per kurį motina yra užsikrėtusi infekcija: rizika nėštumo pradžioje yra nedidelė ir didėja su laiku. Priešingai, vaiko praneštos žalos sunkumas yra didesnis, tuo greičiau atsiranda motinos ir vaisiaus perdavimas. Infekcijos atvejų, įvykusių per šeštąjį nėštumo mėnesį, atveju gali atsirasti persileidimas, priešlaikinis gimdymas arba gimdymas vaisiui po gimdymo, gali sukelti chorioretinitą, hidrocefaliją (arba mikrocefaliją) ir intrakranijinius užkrėtimus. Šie neurologiniai požymiai gali būti susiję su bėrimu, regos nervo atrofija, nistagmu, gelta, miokarditu ir pneumonija.
Tikėtinos toksoplazmozės atveju ir Toxo testu patvirtinus, norint sužinoti, ar Toxoplasma gondii iš tikrųjų kerta placentos barjerą ir užsikrėtė vaiku, nurodomas amniocentezės (ne anksčiau kaip 15 nėštumo savaitės) vykdymas. Tyrimo metu paimtas ir PCR (polimerazės grandinės reakcija) atliktas amniono mėginys leidžia patvirtinti parazitinės DNR buvimą, taip diagnozuojant vaisiaus užkrėtimą. Kita vertus, ultragarso stebėjimui gali pasireikšti vaisiaus pažeidimo požymiai (intrakranijinės kalcifikacijos, hidrocefalija, hepatomegalia, intrauterinis augimo sulėtėjimas). Po gimimo įtarimas dėl įgimto toksoplazmozės iš esmės patvirtinamas serologiniais tyrimais ir ligos požymiais, kurie gali pasireikšti net po daugelio metų, ypač gydymo nebuvimo metu.
