Japonų encefalitas yra plačiai paplitęs beveik visose Azijoje ir kai kuriuose Okeanijos regionuose. Infekcijos rizika dažniausiai yra ribota daugeliui keliautojų, tačiau reikia atsižvelgti į paskirties vietą, buvimo laiką ir veiklą, vykdomą buvimo metu.
Pavojingos vietovės daugiausia yra kaimo ir žemės ūkio teritorijos, ypač tos, kurios skirtos ryžių auginimui, kurioje ši liga yra endeminė. Tačiau atvejai, esantys miesto centruose ar šalia jų, nėra reti, jei sąlygos yra palankios uodų vystymuisi.
Pietryčių Azijoje rizika susirgti užsikrėtusių uodų įkandimu yra ištisus metus, o akcentai prie lietaus sezono iki sauso sezono pradžios; Kita vertus, vidutinio Kinijos, Japonijos ir Korėjos pusiasalio regionuose perdavimas yra didesnis nuo gegužės iki rugsėjo (didžiausias vežėjų veiklos laikotarpis). Keliaujant į endemines vietas gali būti rekomenduojama skiepyti.
